COVID 19 / SARS-Cov-2 / 2019-nCoV

coronavirus
Les coronavirus (CoV) sont un grand groupe de virus qui proviennent généralement de nombreuses espèces animales différentes. Certains coronavirus peuvent contourner l’homme et provoquer des infections respiratoires, notamment des symptômes légers et froids. Certains coronavirus, notamment le syndrome respiratoire du Moyen-Orient (MERS) et le syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS), sont beaucoup plus graves et ont même tué des milliers de personnes.
SARS-CoV-2 (2019-nCoV)
Officiellement appelé SARS-CoV-2, 2019-nCoV est un autre nouveau coronavirus contagieux qui peut infecter l’homme et provoquer une épidémie de maladie respiratoire (COVID-19). Il a été détecté pour la première fois à Wuhan, en Chine, en décembre 2019 et est signalé par un nombre croissant de sites internationaux. Le 10 avril 2020, plus de 1 631 000 cas de COVID-19 causés par le SRAS-CoV-2 ont été enregistrés dans le monde et plus de 97 200 personnes ont été tuées. La propagation rapide du SRAS-CoV-2 d’une personne à l’autre est une menace imminente pour la santé publique. L’OMS a déclaré une pandémie le 11 mars 2020.
Les autorités sanitaires chinoises ont été les premières à isoler le SRAS-CoV-2, le virus de la pneumonie sur le marché des fruits de mer, à isoler Wuhan Wuhan-Hu-1 et à lancer l’intégralité de la séquence du génome en 2019 – nCoV, qui est
90% de similitude nucléotidique avec un groupe de coronavirus du SRAS. L’analyse de la séquence des protéines a révélé que les actions 2019-nCoV
80% d’identité de séquence avec le SRAS-CoV et 96% d’identité de coronavirus à l’échelle du génome. Le CDC EE. États-Unis Ils ont également publié l’intégralité du génome du virus SARS-CoV-2 détecté chez des patients américains et ont constaté que les séquences de patients américains étaient similaires à celles publiées à l’origine par la Chine.
Le génome du coronavirus
Comme le MERS et le SAR, le SARS-CoV-2 est également un virus à ARN à brin positif simple brin. Le génome du coronavirus code quatre protéines structurales majeures, dont la protéine Spike (S), la protéine nucléocapside (N), la protéine d’enveloppe (E) et la protéine membranaire (M), en plus de plusieurs protéines accessoires. cadre de lecture ouvert (ORF).
Le coronavirus nucléocapsidique (N) est une protéine structurelle multifonctionnelle. La protéine CoV N forme des complexes ribonucléocapidiques hélicoïdaux avec de l’ARN viral génomique positif et interagit avec la protéine de la membrane virale pendant l’assemblage du virion et joue un rôle important dans l’amélioration de l’efficacité de la réplication, de la transcription et de l’assemblage du virus.
La protéine Spike Coronavirus (S) est une grande protéine transmembranaire oligomère qui assure la médiation de l’entrée du coronavirus dans les cellules hôtes. Il contient deux sous-unités S1 et S2. Spike S1 contient principalement un domaine de liaison aux récepteurs (RBD) qui reconnaît une variété de récepteurs à la surface des cellules hôtes. S2 contient les éléments de base responsables de la fusion membranaire. Le coronavirus se lie d’abord à un récepteur à la surface de la cellule hôte via la sous-unité Spike S1, puis fusionne les membranes virale et hôte via la sous-unité Spike S2.
Des études de modélisation structurale des protéines de pointe du SARS-CoV-2 et du SARS-CoV suggèrent que la protéine SARS-CoV-2 S maintient une affinité suffisante pour la protéine de conversion de l’angiotensine 2 (ACE2) et utilise probablement la protéine ACE2 comme récepteur pour entrée de cellule. La dernière étude (4) montre que l’affinité de 2019-nCoV S pour la liaison à ACE2 est 10 à 20 fois supérieure à celle de SARS-CoV S.
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référence
- Zhou, P. et al. Une épidémie de pneumonie associée à un nouveau coronavirus, probablement d’origine chauve-souris. Nature https://doi.org/10.1038/s41586-020-2012-7 (2020)
- Wu, F. et al. Un nouveau coronavirus associé aux maladies respiratoires humaines en Chine. Nature https://doi.org/10.1038/s41586-020-2008-3 (2020).
- Letko, Michael; Munster, Vincent (22 janvier 2020). « Évaluation fonctionnelle de l’entrée des cellules et de l’utilisation des récepteurs pour les lignées de β-coronavirus B, y compris le 2019-nCoV. » BiorXiv: 2020.01.22.915660. doi: 10.1101 / 2020.01.22.915660.
- Wrap, D.; Wang, N. et al. (19 février 2020). « Structure Cryo-EM du pic 2019-nCoV en fonction de la pré-fusion ». Science https://science.sciencemag.org/content/early/2020/02/19/science.abb2507 (19/02/2020)
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