How US, Italy And Spain Have Overtaken China With Most COVID-19 Cases?

Les premiers résultats du séquençage du génome indiquent que le virus est stable, probablement lié aux épidémies du nord de l’Italie et du nord de l’Europe.
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Les premiers résultats de la séquençage du génome indiquent que le virus est stable, probablement lié à des foyers dans le nord de l’Italie et à des foyers dans le nord de l’Europe.
L’Institut expérimental de zooprophylactique des Abruzzes et du Molise est entré dans le réseau Covid19 dans les Abruzzes suite à l’autorisation du Ministère de la santé 13 mars. En étroite collaboration avec le conseiller pour la santé de la région des Abruzzes, Nicoletta Verì, l’IZSAM a initié le diagnostic de Covid19 à partir de prélèvements effectués sur les personnes présentant des symptômes ou prises lors du dépistage du personnel de santé et des contacts potentiels, conformément aux protocoles du laboratoire de référence de l’hôpital régional de Pescara.
Du 16 mars au 1er avril, IZSAM a examiné environ 5 000 échantillons cliniques respiratoires (écouvillons): il analyse actuellement environ 500 échantillons par jour, avec deux lignes de travail distinctes qui emploient 50 unités jusqu’à 17 heures par jour.
En 2017, l’IZSAM a été nommé Centre national de référence pour les séquences génomiques des micro-organismes pathogènes; le personnel du laboratoire de génomique du siège social de Teramo, un laboratoire de pointe qui utilise les plateformes les plus innovantes pour le séquençage de nouvelle génération, a immédiatement commencé à séquencer le génome du virus détecté dans des écouvillons positifs en utilisant des méthodes de nouvelle génération.
« Le principal objectif de l’enquête est de mieux comprendre l’épidémiologie moléculaire de la maladie », explique le directeur général Nicola D’Alterio« Dans toutes nos activités et encore plus dans les phases d’urgence, comme celle que nous vivons, Il est d’une importance fondamentale que la recherche soit développée parallèlement à l’activité diagnostique. Le séquençage du génome du virus est également utile pour détecter mutations ce qui peut conduire à une diminution de la pathogénicité: à cet égard, nous apportons notre soutien épidémiologique au service de prévention de l’ASL de Teramo pour mieux faire face au phénomène pandémique « .
La DG D’Alterio ajoute: « Nous sommes en contact étroit avec la région des Abruzzes afin de rendre le processus d’examen des écouvillons plus efficace, également par le dialogue entre les systèmes informatiques des entités. Nous avons de la chance car nous disposons d’une technologie de pointe qui nous a permis d’organiser rapidement la réception et le reporting des écouvillons. Nous devons remercier le Président Marsilio, le Conseiller régional Dr. Verì et la Protection civile qui ont été d’un grand soutien pour assurer l’amélioration progressive et optimale des activités.
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Coronavirus, l’analyse
Au moment où il a été analysé un premier groupe de 23 échantillons provenant des différents hôpitaux des Abruzzes: Teramo, Atri (TE), Pescara et L’Aquila. Les résultats obtenus indiquent que le virus circulant dans les Abruzzes aujourd’hui est plutôt stable, caractérisé par quelques mutations qui semblent n’avoir aucune influence sur sa virulence.
Les différences constatées dans les génomes séquencés ont également permis de relier le virus à la fois aux foyers d’Italie du Nord (Lombardie et Vénétie) et aux foyers identifiés en Europe du Nord dès fin février. En effet, dans 16 cas le génome viral analysé présente une mutation identique à celle trouvée dans les virus isolés au début de l’épidémie en Angleterre, Belgique, Hollande et Suisse. C’est un résultat pertinent car il peut fournir des informations utiles sur comment le virus entre dans les Abruzzes. Il est donc probable que son introduction est liée à de multiples sources d’infection et pas seulement à celle imputable au foyer du nord de l’Italie.
Pendant ces heures, ils continuent d’autres activités de séquençage du génome du virus afin d’étudier les résultats préliminaires obtenus jusqu’à présent. « Nos activités sont menées en contact étroit et en collaboration continue avec des instituts de recherche d’excellence », conclut D’Alterio, « des entités à la pointe de la lutte contre la pandémie par Covid19 comme l’Institut national des maladies infectieuses Lazzaro Spallanzani. Nous suivons une stratégie commune pour sortir de cette phase d’urgence « .
