Coronavirus: symptômes, contagion, vaccin, ce que nous savons (jusqu’à présent) de Sars-CoV-2

CDL26b Coronavirus je me suis trompé… Conversation du lundi #26B 22

Un ennemi connu, ne serait-ce qu’en termes généraux, avec des caractéristiques spécifiques et un avenir envisageable. Voici tout ce que nous savons et les scénarios de ce qui manque encore

par Silvia Turin

Nous avons un certain nom pour le virus qui révolutionne la planète: SARS-CoV-2 et un pour la maladie qu’il déclenche, COVID-19. Ces derniers mois, nous avons appris à bien les connaître, malgré le fait que différentes implications restent des hypothèses, souvent plausibles. Nous faisons le point sur certaines certitudes, sachant que d’un point de vue scientifique, ce sont des « certitudes » jusqu’à preuve du contraire.

Où et quand il est né

Le virus a été détecté pour la première fois à Wuhan, en Chine, à la fin de 2019, à partir d’un groupe de cas de personnes qui avaient fréquenté un marché d’animaux (même sauvages), un soi-disant « marché humide ». Le « patient zéro » n’a jamais été retrouvé, mais il semble remonter à octobre-novembre, quelques semaines plus tôt que les cas de pneumonie anormale identifiés et signalés par le « médecin héros », Li Wenliang, décédé en Chine des suites du virus.

Comment c’est arrivé à l’homme

Le coronavirus, officiellement appelé Sars-CoV-2, est étroitement lié aux virus qui infectent les chauves-souris, mais on ne sait toujours pas ce que l’animal « pont » était entre la chauve-souris et les humains. Le chaînon manquant, dont certains pensent qu’il s’agit du pangolin, reste inconnu et pourrait être à l’origine de nouvelles infections à l’avenir. Il est également vrai que le virus est capable d’infecter plusieurs mammifères, étant donné que sa présence a été détectée chez les chiens, les chats, les furets, les tigres: cela signifie qu’il y a probablement eu un hôte intermédiaire.

Quand il s’est répandu en Europe

Quand s’est-il propagé en Europe? Le «patient zéro» européen semble être – par convention, car ce n’est pas une certitude – un Allemand positif de 33 ans en Allemagne le 24 janvier. Les 20 et 21 janvier, elle avait assisté à une réunion à laquelle un collègue de Shanghai était présent, qui est resté en Allemagne du 19 au 22 janvier sans aucune perturbation. La femme a cependant commencé à se sentir mal lors du vol de retour vers la Chine, où elle a été trouvée positive pour le virus 2019-nCov le 26 janvier.

Et en Italie

Bien que notre cas 1 remonte au 21 février, il semble que la diffusion italienne soit à prévoir probablement avant même le cas zéro allemand. Une étude menée par le laboratoire de la Clinique des Maladies Infectieuses de DIBIC, à l’Hôpital Sacco de Milan (ASST Fatebenefratelli Sacco à Milan) réalisée sur les variations du génome viral affirme qu’en Italie, le virus aurait pu pénétrer avant même le blocage des vols en provenance de Chine.

Comme c’est contagieux

Le coronavirus peut infecter en moyenne 2 à 3 personnes à la fois. Cette valeur, le taux de contagiosité ou « erreur avec zéro » (Ro) dépend en partie des caractéristiques biologiques du virus, par exemple la rougeole est beaucoup plus contagieuse que le SRAS-CoV-2 atteignant Ro = 18 et la grippe au lieu de cela moins et atteint R0 = 1,3, mais pas seulement: le niveau de densité de la population compte également, c’est-à-dire combien de personnes se rencontrent, pendant combien de temps, pendant combien de temps. La valeur R0 varie dans le temps. En Italie, une étude récente (non révisée) menée par des chercheurs italiens et grecs a mesuré le taux de contagiosité pour la Lombardie du 21 février au 8 mars, jour du premier bloc total et a donné 4,04.

Comme c’est mortel

Le taux de létalité est une valeur « apparente ». Tant que nous ne savons pas combien de cas il y a eu, il est impossible d’être certain du taux de létalité ou de mortalité. À l’heure actuelle, on estime qu’environ 1% des personnes infectées par le virus meurent. Mais s’il y a beaucoup de patients asymptomatiques, le taux peut être inférieur. En revanche, le nombre de décès par coronavirus n’est pas aussi certain dans les différents pays.

Pour en savoir plus

Combien de personnes ont été infectées

C’est l’une des questions les plus élémentaires, mais aussi l’une des plus cruciales et difficiles à répondre. Il y a eu des centaines de milliers de cas confirmés dans le monde, mais ce n’est qu’une fraction du nombre total d’infections. Et les chiffres sont encore plus confus par un nombre inconnu de cas asymptomatiques: les personnes qui ont le virus mais ne se sentent pas mal. Le développement d’un test d’anticorps permettra aux chercheurs de voir combien d’entre eux ont eu le virus, mais des études sur des échantillons représentatifs sont nécessaires. Le nombre dépend également de la façon dont les tampons sont réalisés et la communication des cas est gérée: certaines études qui prennent en compte toutes les variables multiplient la valeur finale par dix, mais il n’y a aucune certitude.

Comment suivre un cas positif

Le test pour vérifier si une personne est positive est le prélèvement laryngopharyngé, un test moléculaire qui nous dit une chose importante: si nous sommes contagieux, que nous soyons guéris cliniquement ou non. L’écouvillon est positif lorsque la charge virale dans la muqueuse dépasse un certain niveau et ne commence pas nécessairement le premier jour de l’infection ou le premier jour des symptômes. De même, il ne se termine pas pour tout le monde après un nombre égal de jours.

Quand on n’est plus contagieux

Nous sommes positifs et contagieux tant que la charge virale est élevée dans nos muqueuses. La durée et la force du virus dans notre corps changent d’une personne à l’autre, en moyenne ceux qui ont eu une évolution plus défavorable restent positifs plus longtemps, même un mois. Ceux qui ont eu un écouvillon positif et ont récupéré sont testés à nouveau et si le test est négatif deux fois de suite en 24 heures, il n’est plus contagieux. Cela ne coïncide pas nécessairement avec la guérison clinique, ni avec la fin des symptômes. Pour cette raison, en tant que convention, pour être sûr qu’il est dit qu’une personne qui ne présente plus de symptômes doit rester isolée pendant 14 jours avant de retourner dans la communauté.

Comment il est transmis

Le SRAS-CoV-2 est transmis de personne à personne par les voies respiratoires. Ce sont les gouttelettes infectées qui peuvent atteindre la bouche, le nez et les yeux d’une personne et faire pénétrer le virus. Même les mains qui sont entrées en contact avec ces gouttelettes et sont portées au visage peuvent être porteuses de l’infection.

Les surfaces

Le virus peut rester sur les surfaces même des jours. La charge virale diminue cependant au fil des heures et il n’a jamais été prouvé qu’elle suffit à infecter une personne. Avec une désinfection normale, il a été démontré que le virus est éradiqué en une minute.

l’air

Le virus peut « voyager » dans l’air lorsqu’il est émis par la toux et les éternuements d’une personne infectée. Normalement, les gouttes « contagieuses » et lourdes tombent au sol après l’émission. Les gouttelettes plus légères peuvent se déplacer dans un nuage sur plusieurs mètres mais elles se dissolvent quand même. La présence d’une personne est le facteur le plus dangereux et parler ou interagir avec quelqu’un qui manifeste des symptômes de la maladie, ne passe pas par une personne ou dans le même environnement après que le patient y soit allé.

Comment nous protégeons-nous

Se laver les mains reste l’un des obstacles les plus efficaces. Alors ne touchez pas votre visage et protégez votre nez, votre bouche et vos yeux. La distance sociale résout évidemment les problèmes de contagion par elle-même, les masques sont utiles lorsque nous rencontrons d’autres personnes et nous ne pouvons pas garder la distance recommandée d’au moins un mètre.

Les masques sont nécessaires

Les masques peuvent aider à ne pas propager le virus à l’extérieur et si nous les mettons tous ce serait (en l’absence de distanciation) une barrière supplémentaire également pour « se défendre » des personnes asymptomatiques, positives sans symptômes.

Quels sont les principaux symptômes

Les principaux symptômes du coronavirus sont la fièvre, la toux sèche et la détresse respiratoire. Dans certains cas, des maux de gorge, des maux de tête et des diarrhées ont également été signalés et il existe de plus en plus d’hypothèses selon lesquelles une perte de l’odorat et du goût est caractéristique, en particulier au stade de la guérison.

L’asymptomatique

Certains patients présentent des symptômes légers ou absents. Ce sont les fameuses personnes infectieuses asymptomatiques sans savoir qu’elles sont porteuses du virus.

La pire complication, la pneumonie

Lorsque le virus atteint les poumons, les muqueuses s’enflamment. Cela peut endommager les alvéoles ou les poches pulmonaires qui doivent travailler plus dur pour remplir leur fonction d’approvisionnement en oxygène du sang qui circule dans notre corps et d’élimination du dioxyde de carbone du sang. Un gonflement et une altération du débit d’oxygène peuvent faire en sorte que ces zones des poumons se remplissent de liquide, de pus et de cellules mortes provoquant une pneumonie. Précisément à cause de cette dégénérescence, certains patients éprouvent de graves problèmes respiratoires, à tel point qu’ils doivent être hospitalisés en soins intensifs et ventilés. Dans le pire des cas, lorsque survient un syndrome de détresse respiratoire aiguë, les poumons se remplissent à un point tel que aucun soutien respiratoire ne peut aider le patient, qui ne peut plus respirer et meurt.

Quelles catégories de personnes le virus affecte-t-il le plus sérieusement?

Certaines catégories de personnes prennent plus de risques avec COVID-19. Ce sont les personnes âgées, les personnes atteintes d’autres maladies chroniques ou en cours et pas autant les hommes et les fumeurs.

Des femmes et des enfants plus protégés

Les femmes semblent plus protégées contre le COVID-19 que les hommes: elles tombent moins malades et, surtout, meurent moins. Parmi les hypothèses, le rôle des hormones protectrices de toute une série de pathologies jusqu’à la ménopause. Même les enfants sont un peu plus protégés: en moyenne, ils attrapent le virus moins violemment et cela semble être dû à leur jeune système immunitaire.

Comment y remédier

La certitude est que pour l’instant il n’y a pas de remède spécifique, un médicament qui agit sélectivement contre ce type de virus, mais il existe des mélanges de médicaments efficaces et d’autres médicaments (même parmi ceux connus pour d’autres pathologies) qui semblent donner de bons résultats. résultats en attente de confirmation.

Mutations du virus

En parlant des caractéristiques intrinsèques d’un virus, il est important de comprendre s’il va changer ou est en train de changer: il est utilisé pour comprendre s’il rend immunitaire et pour le vaccin. Les virus changent constamment, mais la plupart des modifications de leur code génétique ne font pas de différence significative. En règle générale, les virus évoluent généralement moins mortellement à long terme (comme cela s’est produit au SRAS), mais cela n’est pas garanti. La préoccupation est liée au fait que si le virus change, le système immunitaire ne le reconnaît plus et un vaccin spécifique ne fonctionne plus (comme c’est le cas avec la grippe). Pour l’instant, ce coronavirus ne semble pas changer, mais son histoire dans l’espèce humaine est encore trop récente.

Le vaccin

Quand le vaccin arrivera-t-il? Les prédictions des experts varient beaucoup: de ceux qui croient que nous pourrions l’avoir dans un an, comme Rino Rappuoli l’a récemment déclaré à Corriere della Sera, qui est l’une des plus hautes autorités mondiales dans ce domaine, à ceux qui pensent qu’il faudra plus, jusqu’à qui émet l’hypothèse que nous ne l’aurons jamais. En tout état de cause, après avoir été fabriqués en laboratoire et testés sur des modèles animaux, les vaccins doivent être testés sur l’homme pour vérifier tout d’abord leur innocuité puis leur efficacité sur un nombre suffisant de personnes dans des conditions contrôlées, et cela nécessite cependant plusieurs mois en meilleur scénario.

l’immunité

Certains virus développent une immunité permanente, d’autres non, d’autres temporaires. L’exposition aux quatre coronavirus endémiques existants produit une immunité qui dure plus longtemps que celle contre la grippe, mais n’est pas permanente. Pour l’instant, nous ne savons pas comment ce virus se comportera.Si nous devons nous fier au SRAS et à d’autres coronavirus, l’immunité devrait durer quelques années.

Le test d’immunité

L’immunité personnelle se produit avec un test sanguin sérologique qui détecte si nous avons eu la maladie et développé des anticorps. Les anticorps recherchés sont essentiellement de deux types: les IgM (Immunoglobulin M), qui surviennent dans les 7 jours environ suivant l’apparition des symptômes et permettent de confirmer le diagnostic d’infection avec une grande précision et les IgG (Immunoglobulin G), produites après 14 jours, qui sont notre « mémoire immunitaire » et nous protègent même si, dans le cas de Sars-CoV-2, nous ne savons pas combien de temps et dans quelle mesure.

Les mesures de restriction fonctionnent

La distanciation sociale: garder ses distances, respecter la quarantaine, ne pas sortir, ne pas rencontrer d’autres personnes, ne pas se rassembler. Au final, tous les pays ont dû se rendre à l’évidence qu’un certain seuil de distanciation sociale est nécessaire. D’autant plus restrictif que l’on perd du temps (par négligence ou par circonstances ou les deux) dans la toute première phase d’une flambée: lorsqu’il est difficile de remonter aux chaînes de l’infection et de retrouver les contacts étroits des premiers cas, il ne reste plus qu’à fermer le plus grand nombre de personnes pour réduire le taux de contagiosité.

Le pic

Nous avons appris que le pic est le pire point, mais aussi le début de la descente. Bien que, heureusement, dans notre cas, cela ressemble plus à un plateau, c’est quand le pourcentage de croissance quotidienne commence à baisser.

Été et températures

Le rhume et la grippe sont plus courants en hiver qu’en été, mais on ne sait pas encore si le temps plus chaud modifiera la propagation du virus. Certaines études convergent sur l’hypothèse que COVID-19 préfère un climat frais et sec par rapport aux pays à climats chauds et humides. Un phénomène déjà connu pour le virus du SRAS. Cependant, il ne suffirait pas à lui seul de régler des affaires. En ce qui concerne le virus du SRAS, la virologue Ilaria Capua, directrice du One Health Center of Excellence de l’Université de Floride, a répété qu ‘ »il a disparu en été: non pas à cause de la chaleur, mais à cause de l’isolement. La pandémie espagnole a mis deux ans à voyager à travers le monde car elle « est allée » à pied et avec des bateaux « : pas comme le coronavirus, qui s’est propagé à l’ère de la mondialisation. Sars-CoV-2, a-t-il ajouté, « n’est pas un virus super-résistant, au contraire il est fragile » mais il se transmet avec une grande facilité et ne disparaîtra pas en été « .

La deuxième vague

Plusieurs virus sont récurrents, par exemple le MERS qui n’a jamais cessé. L’espoir pour ce coronavirus est qu’il maintiendra la pathogénicité et la létalité relativement limitées actuelles et qu’il ne changera pas génétiquement. La deuxième vague pourrait commencer par une réimportation de cas provenant de régions du monde où l’infection avait une tendance plus retardée. Le problème en général est la non-synchronisation des flambées épidémiques dans le monde. Il est vrai qu’à ce stade, nous serons mieux préparés à y faire face.